В 1870 году в деревне Пески на средства крестьян лютеранского вероисповедания было открыто начальное училище для детей обоего пола, с преподаванием на финском языке. На следующий год его перевели в деревню Аннино. В 1908 г. было преобразовано в светское земское училище с преподаванием на русском языке.

В 1894 году в деревне Аннино на средства крестьян Шунгаровского сельского общества было открыто Аннинское параллельное училище для детей православного вероисповедания.

В 1935 году во время большого пожара сгорело более 30 домов, в том числе и школа. После пожара было построено три двухэтажных деревянных дома. Один из них был отведен под школу. Первым директором этой школы была Патури Роза.

1934 – 1953 года – начальная школа в д. Аннино.

В 1953 году школа становится семилетней.

В 1960 году школа восьмилетняя.

В 1982 году преобразуется в среднюю, обучая своих учеников до уровня 10-11 класса.

В 1966 году Аннинская школа из старого деревянного здания на ул. Школьной (старое Аннино) переезжает в новое двухэтажное кирпичное здание в п. Аннино.

В 1983 году к школе пристроено новое здание, в котором расположились классы средней школы.

В 2022 году проведен капитальный ремонт по программе «Комплексное развитие сельских территорий»